Prof. Dr. Fadlil Munawwar Manshur, M.S. pada saat ini secara formal homebasenya sebagai dosen tetap pada Program Magister Kajian Budaya Timur Tengah (KBTT), Departemen Antarbudaya dan pada Program Studi Sastra Arab Departemen Bahasa dan Sastra, Fakultas Ilmu Budaya (FIB), Universitas Gadjah Mada (UGM). Di almamaternya, UGM, ia memperoleh gelar Sarjana Muda (B.A.) pada tahun 1981, gelar Sarjana Sastra (DRS) pada tahun 1984, gelar Magister Sains (M.S.) pada Jurusan Ilmu-Ilmu Humaniora, Program Studi Sastra Indonesia dan Jawa, Program Pascasarjana UGM tahun 1992, gelar Doktor dalam Ilmu Budaya (Sastra) pada Sekolah Pascasarjana UGM dengan predikat Predikat Cum Laude pada tahun 2007, dan pada tanggal 1 Juni 2023, ia mendapat SK Jabatan Fungsional Guru Besar dalam bidang ilmu budaya Arab dari Menteri Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi RI.

Selain itu, saat ini ia juga menjadi dosen pada Program Doktor Ilmu-Ilmu Humaniora FIB UGM, dosen luar biasa pada Fakultas Filsafat UGM (1995-2005), dan dosen pada Program Studi Agama dan Lintas Budaya, Minat Kajian Timur Tengah Sekolah Pascasarjana UGM (2007-2010). Selain aktif dalam sejumlah kegiatan ilmiah di dalam negeri, ia juga beberapa kali menjadi narasumber dan peserta pada beragam forum ilmiah di beberapa negara: Mesir, Amerika Serikat, Australia, Inggris, Prancis, Belanda, Belgia, dan Jerman. Sejumlah jabatan dalam bidang akademik di UGM pernah ia diamanahi menjadi Ketua Redaksi Jurnal Humaniora FIB UGM (1988-2009), Wakil Ketua Program Magister Sastra FIB Budaya UGM (2007-2009), Anggota Senat Akademik UGM Wakil Non-Guru Besar (2007-2012), Anggota Panitia Khusus Senat Akademik UGM (2007-2009), Anggota Senat FIB UGM (2008-2012), Anggota Komisi Kegiatan Akademik FIB  UGM (2008- 2010), Anggota Komisi Penelitian Departemen Bahasa dan Sastra FIB UGM (2022-2027). Selama berkarir di bidang akademik pada tahun 1992, ia telah menghasilkan 133 karya ilmiah, baik yang dipublikasikan maupun yang tidak dipublikasikan (lihat tautan google scholar: https://scholar.google.co.id/citations?user=8jMN8C4AAAAJ&hl=en). Karya ilmiah yang dipublikasikan tersebut dimuat di berbagai jurnal nasional terakreditasi dan jurnal-jurnal  internasional bereputasi yang terindeks Scopus (Q1, Q2, dan Q3). Di samping itu, sebagian karya-karya ilmiahnya telah memperoleh Sertifikat Hak Kekayaan Intelektual (HAKI) dari Direktorat Jenderal Kekayaan Intelektual, Kementerian Hukum dan HAM RI.

Selain karier di bidang akademik, pada saat ini, ia juga aktif dalam bidang pendidikan, dakwah, sosial, dan budaya, antara lain sebagai Pengasuh Pondok Pesantren Darussalam Ciamis-Jawa Barat, Pembina Yayasan Kesejahteraan Pendidikan Islam (YAKPI) Al- Fadliliyah Darussalam Ciamis, Ketua Yayasan Pendidikan Islam (YPI) Kaffah Darussalam Ciamis, Ketua Dewan Kiai Pondok Pesantren Al-Husni Pagersari, Pagerageung, Tasikmalaya, Wakil Pemimpin Perusahaan Majalah Wanita Suara ’Aisyiyah Yogyakarta (1992-2006), Anggota Badan Pengkajian dan Pengembangan, Pimpinan Pusat Muhammadiyah, Yogyakarta (1995-2000), Pengurus Majelis Ulama Indonesia (MUI) Kabupaten Ciamis (1997-2000), Pengurus Pusat Ikatan Pengajar Bahasa Arab se-Indonesia (IMLA), Ketua Divisi Hubungan Luar Negeri dan Publikasi (1999-2011), Sekretaris Yayasan Pusat Kajian Pernaskahan Yogyakarta (2002-2004), Dosen Luar Biasa pada Program Studi Agama dan Filsafat Program Pascasarjana Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga Yogyakarta (2005-2007), Ketua Lingkar Kalam Ulin Nuha (LKUN) Yogyakarta (2018-2024), Wakil Ketua Dewan Pakar ICMI Orwil Jawa Barat (2022-2027).